はい、カウントの対象として含まれます。

ワークグループ版、エンタープライズ版に関係無く、「サブマップ、GoTo、リンク、ネットワーク」といったオブジェクトも、監視対象デバイス用オブジェクトと同様に、「登録オブジェクト数」としてカウントされます。